鱼体的肉眼检查，简称目检，在实际生产中，目检是检查鱼病的主要方法之一。目检可以观察到病原体侵袭机体后机体表现出的各种症状，对于某些症状表现明显的疾病，有经验的技术人员凭借经验即可作出初步诊断。另外，一些大型病原体如较大的寄生虫，肉眼也可观察到。一般病毒性和细菌性鱼病，通常表现出充血、发炎、腐烂、脓肿、蛀鳍、竖鳞等。根据病鱼表现出的症状，大致确定为某种类型的鱼病。
寄生虫引起的鱼病，常表现出粘液过多、出血、羽点状或块状的孢囊等，根据寄生部位和所引起的症状不同，有的凭肉眼即可做出较为准确的诊断。对鱼体的检查，主要检查体表、鳃、内脏三部分。检查顺序和方法如下：
1.体表 。将病鱼置于白搪瓷盘中，按顺序从嘴、头部、鳃部、体表、鳍条依次观察。寄生于体表的线虫、锚头鳋、鱼鲺、钩介幼虫、水霉等大型病原体肉眼就能确定。对肉眼看不出来的小型病原体，则主要根据表现出来的症状加以辨别，口丝虫、车轮虫、斜管虫、三代虫等引起的病状，一般会分泌大量粘液，有时微带污泥，或者是嘴、头以及鳍条末端腐烂，但鳍条基部一般不充血。疖疮病则表现为病变部位发炎、脓肿。白皮病病变部位发白，粘液少，用手摸有粗糙感。复口吸虫表现出眼球混浊，后期出现白内障。但有些病症，如鳍条基部充血和蛀鳍，则都是赤皮病、肠炎、烂鳃病以及其他一些细菌性鱼病的病症之一；大量的车轮虫、斜管虫、小瓜虫、指环虫等寄生虫寄生于鱼的体表或鳃上，同样都会刺激鱼体分泌较多的粘液。目检可以初步诊断体表寄生虫病，但对其他疫病，目检仅仅是诊断的第一步。
2．鳃 。检查鳃部，重点是鳃丝。先看鳃盖是否张开，然后用剪刀小心把鳃盖剪掉，观察鳃片上鳃丝是否肿大或腐烂，鳃的颜色是否正常，粘液是否增多等。如果是鳃霉病，则鳃片颜色发白，略带微红色小点；若是车轮虫；若是细菌性烂鳃病，则鳃丝末端腐烂，严重的病鱼鳃盖内中间部分的内膜常腐蚀成一个不规则的圆形“小窗”； 若是车轮虫、斜管虫、鳃隐鞭虫、指环虫、三代虫等寄生虫引起的鱼病，鳃片上则会有较多粘液；若是中华鳋、双身虫、狭腹鳋、粘孢子虫孢囊等寄生虫，则常表现为鳃丝肿大，鳃盖胀开等症状；小瓜虫、孢子虫大量寄生时，肉眼即可见大量白点，因此常被称为“白点病”。
3．内脏 。检查内脏时，应先把一边的腹壁剪掉，剪腹壁时注意不损伤内脏。先观察是否有腹水或肉眼可见的较大型的寄生虫。其次是观察内脏的外表，如肝脏的颜色、胆囊是否肿大以及肠道是否正常，然后将靠近咽喉部位的前肠和靠近肛门部位的后肠剪断，取出内脏后，把肝、肠、鳔、胆等分开，再把肠分为前肠、中肠、后肠三段，轻轻去掉肠道中的食物和粪便，然后进行观察。绦虫、吸虫、线虫等内寄生虫，很容易就能看到；如果是肠炎，则会发现肠壁发炎、充血；如果是球虫病和粘孢子虫病，则肠道中一般有较大型的瘤状物，切开瘤状物有乳白色浆液或者肠壁上有成片或稀散的小白点。
