一、品种退化的原因。品种退化的原因是多方面的，也较为复杂，有的甚至由几个原因交错在一起共同起作用。
（一）近亲繁殖。在养殖过程中，由于繁育群体较小，加上留种不当，时常发生不同程度的近交。因此，潜在和混人的隐性有害基因就有很多纯合的机会，近交愈烈，不仅每一有害基因纯合机会越多，而且潜在的有害基因纯合位点也越多，这样直接导致品质下海和生命力低下等近交衰退现象。
（二）不良养殖条件。水产生物的大多数E济性状都属于数量性状，易受养殖制度和F殖条件的影响 c在不良的养殖条件下，养E对象也会变异井接受自然选择。变好的可能性虽然存在，但变坏的机会更多，并容易在封闭的群体中扩散、发展、定型而影响种群的品质。如果养殖过程中死水代替了活水，周期性缺氧代替了持续稳定的溶氧条件，简单的饵料组成，高浓度的氨氮代替了低浓度的氨氮，过高的放养密度代替了合理的放养密度，那么，本该�贾至加乃锞突岽τ谏砩囊种浦校佣跋烨妆镜挠纯觥⒎⒂纯瞿酥梁蟠柿俊Ｈ绻庑┎涣蓟肪�周而复始地作用于这些生物的若干世代，良种将在变异、遗传和长期的适应中，接受不良生态因子的负选择而退化。
（三）亲本质量差。亲本质量差也是导致品种退化的一个重要原因。不少单位和生产者对用作亲本的个体不仅没有严格地加以正确选择，反而进行逆选择，往往将年龄、规格、质量和来源等都不理想的个体作为亲本，有的甚至将具有严重退化特征的个体作亲本。
（四）没有正确掌握人工繁殖技术。鱼类人工繁殖技术的提高，促进了水产养殖业的飞速发展。但有些生产单位盲目追求出苗数量和高额利润，平时不注意选留优良亲鱼和加强培训，人工繁育时违反科学操作。有的生产单位和养鱼专业户不是依据亲鱼性腺成熟情况，而是机械地套用生产季节，不管性腺成熟与否，盲目催产，一次催产不行，催产两次，两次催产不行又催产第三次，正常剂量不行，就采取高剂量催产，结果使不成熟的卵强行产出，既摧残了亲鱼，又降低了卵子和菌种的质量。更有甚者，还有强迫小规格个体繁殖的，如对1— 1.5Kg 的链鱼和3.5 -4Kg 的草鱼催产，使不及标准亲鱼一半体重的鱼产卵，久而久之，便出现亲鱼体型小、卵粒小和茵种小的现象。这些都是导致品种退化的原因之一。
二、防止品种退化的方法。 针对品种退化的原因，防止品种退化的方法主要有以下几方面：
（一）避免近亲繁殖。品种在推广和养殖过程中，应该建立良好的繁育体系，必须建立良好的繁育场以提供优良的亲本。对已建立的优良品种，为了减少近交系数，生产苗种的父本和母本不宜在同一家系中选择，更不宜在己退化的种群中选择，而应在不同品系中选配。
（二）扩大随机交配群体。在封闭群体里，从上代到下代近交系数的递增速度取决于繁衍下一代的有效亲本数量。因此，在引种或移植中，对引进种类的质量和数量都要讲究。除了引进个体间不要有亲缘关系外，还要有足够的个体数量，使自群交配繁殖的后代保持较大的群体杂合性，降低近交系数，以防止品种退化。
（三）创造良好的养殖环境。良好的养殖环境与良种相匹配的养殖制度，可以消除或减少引起不利变异的因素，防止人为的负选择作用。
（四）提高亲本的质量。亲本应从健壮的菌种中精选和培育，并参照它们以后备生长阶段的表现来选留，一般不应从商品鱼中选留。精选的亲本应充分体现良种的特征，体型大，体质健壮，体色纯正。培育亲本应在优越的条件下进行，如充足的饵料和清新的水质等，以保证体质健壮、性腺发育良好。亲本要有既定的规格，如：草鱼 7.5Kg 以上。亲本老化后要及时更新，如链顺产3--4年以后，亲鱼就逐年老化，体质变弱，怀卵量减少，应及时淘汰，补充新的亲鱼。
