对税务稽查权一方面必须实行多角度、全方位的监控，这既是实行过程监控的前提或条件，又可以加大监控力度，提高监控层面，更好地运用税务稽查权。另一方面，要建立激励机制，严格奖优罚劣，确保良性运行。更为重要的是，要积极探索，大胆创新，革新现有传统的稽查方法，以通过改革来解决稽查权运行过程中的难点问题。为此应做好以下几方面工作。
一是要实行“阳光稽查”工程，切实开展政务公开，严格落实案件公告办法，实行税务稽查案件向社会通报制度，加强税务稽查的政策宣传和咨询工作，做好稽查信访投诉的接待和处理工作，自觉接受社会监督。
二是要开展实行税务稽查案件的下查一级工作，对部分涉税举报案件或部分日常检查对象，实行下查一级。下查一级案件实行上级统一组织、统一检查、统一管理、统一审理、统一处理，以排除属地检查所无法回避的不良社会干扰，为下级局创造规范执法的良好环境。
三是要定期组织联合复查。国税机关由监察部门牵头，法规、税政、稽查部门共同参与，按下级稽查部门查处的案件的一定比例列作复查对象，复查以卷面审核和实地回访复查相结合的办法进行，复查发现问题严格进行责任追究，以此督促下级稽查部门严格执法。
四是要严格实行执法责任过错追究，要把执法责任作为稽查部门职能工作的重点之一，纳入岗位目标责任考核，并加大责任追究力度，对执法过错，直接责任人的上一级领导要承担连带责任，以促进一级抓一级原则的落实，切实加强基层管理，真正体现奖优罚劣。
五是要大力开展依法行政教育，切实提高稽查干部的执法水平。要推行和完善等级稽查员制度和主、协办稽查员制度，以建立和完善稽查干部的自我激励机制，促进稽查干部队伍建设。
六是要积极革新稽查方法。针对目前税收涉税违法行为存在有相当的普遍性，而许多涉税违法行为的产生是由于纳税人依法纳税意识不强、税收法律法规知识不多、依法办税的能力不高所致。所以解决对纳税人的面上监控，应采用纳税评估方法。而对财务核算健全、依法纳税素质较高的纳税人在检查前，可给予自查申报机会，在实施检查时，以调帐帐面检查为主。对那些帐证不全、依法纳税意识较差的纳税人，则应运用法律赋予的各种稽查手段深查严处，发挥稽查打击功能。通过分类稽查，扩大教育面，缩小打击面，一是有利于规范执法，二是有利于提高稽查社会效果，三是便于对稽查的有效监控。
