春秋时期，黎里在长水（今浙江嘉兴）境内
，吴越槜李交战后，黎里御儿滉为吴越分界之一。唐时黎里属嘉兴范隅乡，为村。后梁开平三年（909年），吴江建县，黎里始属吴江县。北宋时，黎里已形成东、西两个村落。明成化、弘治年间（1465～1505年），黎里居民千百家，为吴江大镇。清宣统二年（1910年），吴江县设9镇，黎里为镇。
民国元年（1912年），吴江、震泽两县合并为吴江县，全县共设18市、乡，黎里为市。
民国18年，吴江县调整区划，县以下设区，区以下设镇，黎里为第四区，市镇分为黎东、黎西两区属镇。
民国三十五年（1946年）十月，黎东镇、黎西镇合并为区属黎里镇。
民国三十八年（1949年）五月四日，黎里解放，设黎里区，黎里镇为区属镇。
1953年1月，黎里镇升格为县属镇。
1953年，黎里镇由区属镇升格为县属镇。
1956年3月，黎里区与芦墟区合并为芦墟区。
1957年10月，吴江县撤区并乡，黎里农村合并为县属黎里乡，黎里镇仍为县属镇。
1958年9月，黎里农村成立人民公社，实行政社合一体制。
1959年2月，黎里镇与黎里人民公社合并，由黎里人民公社管辖。
1965年，镇社分开，恢复黎里镇建制。
1983年7月，黎里公社并入黎里镇，实行镇管村新体制。
2003年12月，北厍镇与黎里镇合并为黎里镇。
2006年10月，撤销黎里镇建制，与芦墟镇合并为汾湖镇。
2013年5月28日，汾湖镇正式更名为黎里镇。更名后原行政区域、政府驻地及隶属关系均不变。
